在面对日益增长的网络安全威胁时，对敏感数据进行有效的保护至关重要。文件系统加密是一种常见且有效的安全措施，可以在Linux服务器上保护数据免受未经授权的访问。以下是设置文件系统加密的步骤和注意事项：

在选择加密方案时，需要考虑安全性、性能和易用性等因素。Linux系统通常提供多种加密方案，包括dm-crypt/LUKS、eCryptfs等。dm-crypt/LUKS是一种较为常见和强大的加密方案，支持全盘加密和分区加密，具有较高的安全性和性能。

使用选定的加密方案对文件系统进行配置。对于dm-crypt/LUKS，可以使用cryptsetup工具来创建加密容器和加密分区，并指定加密算法、密钥长度等参数。在配置过程中，需要设置访问密码或密钥文件来解锁加密文件系统。

通过以上步骤和最佳实践，管理员可以在Linux服务器上有效地设置文件系统加密，提高数据安全性，并降低敏感数据被窃取或泄露的风险。